随着微波技术在各行各业应用的深入，微波杀菌以其快速、节能、彻底等优势已经越来越得到用户的认可。典型的应用有：医疗废弃物的处理、医用衣物的烘干、农业基地菌种土壤的杀菌等。另外，传统的紫外灯采用有电极结构，耗能高、寿命短。而近几年流行的微波无极紫外灯，很好地克服了上述缺点，已经大量应用于环保、食品等各个行业。① 纸张：可对易受污染的化验单，有实验在有一定湿度的环境下对10张化验单5min消毒后、50张化验单7min消毒后,大肠埃希菌、金黄色葡萄球菌、铜绿假单胞菌均已死亡。② 生物制剂:各种无菌分装制剂如滴眼剂、眼膏;破损伤口、黏膜所用药剂配制分装后灭菌,以及分装、配制前所用器具物品的快速消毒灭菌。有研究表明，用900W的微波炉对滴眼瓶消毒3min, 可以杀死全部细菌和霉菌；以800W功率的微波对1kg药丸灭菌6min,对细菌、霉菌的杀灭率均为100%。③ 对可重复使用物品的消毒：有实验对采用800W微波对非一次性13C呼气试验呼气滤嘴消毒5min，结果发现40只微波消毒后的样中,38只无细菌生长,2只样本细菌菌落总数为0.1～1cfu/cm2,未检出致病微生物。④ 口腔印模：口腔印模不能耐受高温高压，制取过程中表面可吸附大量细菌、病毒,如不能有效消毒存在交叉感染风险。研究人员利用微波炉低火（700W×17%）消毒，５min就能有效地杀灭枯草芽胞杆菌黑色变种芽胞；而３min就能杀死乙型肝炎病毒DNA。枯草芽胞杆菌黑色变种芽胞和乙型肝炎病毒的抵抗力强，因此微波消毒也可以有效地灭活其他的细菌和病毒。
